Дослідники знайшли в коронавірусі SARS-CoV-2 загадковий «ген в гені». Чому це важливо?

Нещодавно ідентифікований ген, названий ORF3d, є прикладом так званого гена, що перекривається. Він ховається в ланцюжку нуклеотидів через те, що перекриває закодовані послідовності інших генів, відзначили автори відкриття.

«З точки зору розміру генома SARS-CoV-2 і його родичі є одними з найдовших наявних РНК-вірусів. Отже, вони, можливо, більше піддаються геномному обману, ніж інші РНК-віруси», — пояснює біоінформатик Чейз Нельсон з Американського музею природної історії.

Насправді віруси дуже схильні до того, що у них перекриваються гени, тож це не зовсім шокове відкриття.

Гени, що перекриваються, складно ідентифікувати в генетичних послідовностях, оскільки системи геномного сканування часто можуть пропускати їх під час перегляду рядків генетичного коду: вони запрограмовані на вибір окремих генів, але не обов’язково бачать загальні інструкції, спільні для нуклеотидів сусідніх генів в послідовності.

У контексті таких вірусів, як SARS-CoV-2, це може створити серйозну сліпу зону. Вчені з початку цього року прагнуть зрозуміти якомога більше про цей руйнівний вірус, і хоча деякі аспекти його генетичної структури були з’ясовані, багато чого ми просто ще не знаємо.

«Через відсутність генів, що перекриваються, ми ризикуємо випустити з уваги важливі аспекти вірусної біології. Такі гени можуть бути одним з арсеналу способів, якими коронавіруси еволюціонували для підриву імунітету господаря або передачі самих себе», — каже Нельсон.

Просканувавши геномні бази даних, дослідники виявили, що ген був ідентифікований раніше, але тільки в одному варіанті коронавірусу, що вражає панголінів (виявлений в Гуансі, Китай).

Раніше він також був помилково класифікований як неспоріднений ген ORF3b, який присутній в інших коронавірусах, включаючи SARS-CoV, але насправді це не те саме.

«Ці два гени не пов’язані і кодують абсолютно різні білки», — каже Нельсон.

Єдине, що ми знаємо про загадковий ген, ґрунтуючись на попередньому аналізі крові пацієнтів з COVID-19, — це те, що ORF3d дійсно викликає сильну відповідь антитіл. Для вірусу, який має всього близько 15 відомих генів, відкриття ще одного є значним досягненням. Наскільки це важливо для лікування COVID-19, тепер спробують з’ясувати вчені.

Раніше НВ писав, що вчені з Королівського коледжу Лондона опублікували результати дослідження, згідно з якими ДНК людини впливає на прояв різних симптомів коронавірусу. У роботі дослідники використовували дані про близнюків з ідентичним генетичним кодом.

Дослідження вчених з Великої Британії показало, що «на сприйнятливість до інфекції SARS-CoV-2 може впливати генотип її носія». Іншими словами, вчені підтвердили, що прояв важких симптомів коронавірусу частково залежить від певного набору генів пацієнтів з COVID-19.

Команда медиків використовувала спеціальний мобільний додаток, з допомогою якого у Великій Британії складають дані про людей з COVID-19. Повідомляється, що в цьому додатку зареєстровано близько 2,7 млн користувачів, багато з яких пройшли тест на коронавірус і поділилися своїми симптомами хвороби.

За допомогою технологій машинного навчання експерти проаналізували дані про приблизно 2600 близнюків, які також розповіли про свої симптоми хвороби.